Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Xrcc3Q9CXE6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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