Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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