Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms