Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PclafQ9CQX4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms