Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PsenenQ9CQR7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PsenenQ9CQR7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PsenenQ9CQR7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PsenenQ9CQR7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PsenenQ9CQR7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PsenenQ9CQR7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PsenenQ9CQR7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PsenenQ9CQR7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PsenenQ9CQR7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PsenenQ9CQR7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms