Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CQC3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms