Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp3Q9CQ10 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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