Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nsmce3Q9CPR8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms