Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scd3Q99PL7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Scd3Q99PL7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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