Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup155Q99P88 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms