Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clp1Q99LI9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clp1Q99LI9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms