Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Abcf2Q99LE6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcf2Q99LE6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms