Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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