Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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