Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alpk3Q924C5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms