Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim7Q923T7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim7Q923T7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms