Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim59Q922Y2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms