Protein–RNA interactions for Protein: Q91YU3

Msantd4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd4Q91YU3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msantd4Q91YU3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msantd4Q91YU3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msantd4Q91YU3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msantd4Q91YU3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msantd4Q91YU3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msantd4Q91YU3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msantd4Q91YU3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msantd4Q91YU3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msantd4Q91YU3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msantd4Q91YU3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msantd4Q91YU3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msantd4Q91YU3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msantd4Q91YU3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms