Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx15Q91WE1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms