Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usb1Q91W78 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usb1Q91W78 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms