Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEA8

Rab7b, Ras-related protein Rab-7b, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab7bQ8VEA8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rab7bQ8VEA8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab7bQ8VEA8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rab7bQ8VEA8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rab7bQ8VEA8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rab7bQ8VEA8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rab7bQ8VEA8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab7bQ8VEA8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rab7bQ8VEA8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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