Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf4Q8VE97 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms