Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Smg8Q8VE18 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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Smg8Q8VE18 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smg8Q8VE18 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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