Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a20aQ8VDB9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a20aQ8VDB9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a20aQ8VDB9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a20aQ8VDB9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a20aQ8VDB9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc6a20aQ8VDB9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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