Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc28Q8VCE1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc28Q8VCE1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Dnajc28Q8VCE1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnajc28Q8VCE1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc28Q8VCE1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc28Q8VCE1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc28Q8VCE1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc28Q8VCE1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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