Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2J7

Rell1, RELT-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rell1Q8K2J7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rell1Q8K2J7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms