Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc28bQ8CEG5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc28bQ8CEG5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc28bQ8CEG5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms