Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms