Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms