Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nrip1Q8CBD1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nrip1Q8CBD1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms