Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB96

Rassf4, Ras association domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf4Q8CB96 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rassf4Q8CB96 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms