Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo48Q8CAT8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms