Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dclre1bQ8C7W7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms