Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp38Q8BW70 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp38Q8BW70 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp38Q8BW70 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp38Q8BW70 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp38Q8BW70 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp38Q8BW70 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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