Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Smad3Q8BUN5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smad3Q8BUN5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms