Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms