Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik4Q8BMF5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms