Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Prpf18Q8BM39 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Prpf18Q8BM39 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Prpf18Q8BM39 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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