Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tubgcp5Q8BKN5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tubgcp5Q8BKN5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tubgcp5Q8BKN5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tubgcp5Q8BKN5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tubgcp5Q8BKN5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tubgcp5Q8BKN5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tubgcp5Q8BKN5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tubgcp5Q8BKN5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubgcp5Q8BKN5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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