Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm29Q8BGX2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms