Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Best2Q8BGM5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Best2Q8BGM5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms