Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG67

Efr3a, Protein EFR3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3aQ8BG67 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Efr3aQ8BG67 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Efr3aQ8BG67 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms