Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim19Q80ZU4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms