Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrc27Q80YS5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc27Q80YS5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms