Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms