Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Lrrc1Q80VQ1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Lrrc1Q80VQ1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Lrrc1Q80VQ1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Lrrc1Q80VQ1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc1Q80VQ1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc1Q80VQ1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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