Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cfap100Q80VN0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cfap100Q80VN0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap100Q80VN0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap100Q80VN0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap100Q80VN0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap100Q80VN0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms