Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnphQ80U23 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms