Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms