Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ScocQ78YZ6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ScocQ78YZ6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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